液滴数字PCR检测系统及全自动液滴数字PCR系统
一、背景:
1、方法学比较
现有血培养方法存在的的问题:
· 低的阳性率
· 长的检测周期(3~5 天)
· 相对容易的污染(如凝固酶阴性葡萄球菌等)
· 缺乏定量病原学结果
2、数字 PCR 方法的优势
· 超早期检测(<24 小时)
· 对于脓毒症预警
· 在脓毒症发生过程中进行定量监测病原的水平
3、其他可用于血流感染分子生物学方法包括:
· 荧光定量 PCR
· 基于 PCR 的芯片杂交的方法
· 宏基因组方法
现在基于荧光定量 PCR 的方法敏感度很低,例如罗氏的 SepiFast, 只有 50%的敏感度。韩国 SeeGene 的 Magicplex 只有 29.2%的敏 感度。无法满足临床的需求,而且这类方法没有提供耐药的结果,因此对于治疗指导效果有限。
宏基因组方法缺点在于更加耗时,成本更高,另外在血流中检测耐 药基因的方法也不成熟。而且宏基因组需要一个专业的生物信息团队 来解读结果,导致总耗时更长。
因此在血流感染的情况下,宏基因组和数字 PCR 相比没有明显的 优势,而且不能监控病原数量的变化。
和血培养相比,数字 PCR 方法具有更短的报告时间和更高的灵敏度。和基于 qPCR 的方法和 mNGS 相比,ddPCR 的优点在于可以诊断耐药基因和更高的阳性检出率。而且 ddPCR 可以缩短报告周期。
数字 PCR 可以成为超早期诊断和指导脓毒症 24 小时内启动精准治疗的重要方法。
二、应用领域:
1、肿瘤液体活检:非小细胞肺癌、乳腺癌、胰腺癌、软巢癌、急性淋巴细胞白血病、脑胶质瘤、结直肠癌、肝癌、黑色素瘤、胃肠道间质瘤、前列腺癌、甲状腺癌
2、病原微生物体检测:铜绿假单胞菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、金黄色葡萄球菌、粪肠球菌
3、遗传与生殖:唐氏筛查、遗传性耳聋、地中海贫血症、杜氏肌营养不良症、单基因遗传病、其他罕见病
4、政府与科研:疾控/海关、农业与食品安全、核酸质控/验证、基因编辑、转基因检测、司法鉴定
三、产品特点:
1、全自动化
芯片进,结果出,全程仅需2小时,告别“芯片/液滴大挪移
2、独家7色荧光通道
多靶标同体系联检,拓展了多重检测的应用空间
3、全封闭体系
样本液滴生成、PCR扩增、扫描分析过程全封闭,避免气溶胶污染
4、桌面式仪器
仪器小巧,操作简便,满足在简凑的PCR实验室中的摆放运行
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