北京协和医院是洛克菲勒基金会在华最大、最著名的一项事业。

2018年12月4日消息，被国家卫健委公布为首批肿瘤多学科诊疗试点医院。2019年11月10日，复旦版《2018年度中国医院排行榜》发布，北京协和居首。2020年4月，被列入北京市面向团体和个人提供新冠病毒核酸检测服务医疗机构名单。2021年8月，中国医学科学院北京协和医院眼科病房被评选为第20届全国青年文明号。  

2021年11月20日，由复旦大学医院管理研究所邀请国内著名同行专家担任评审的复旦版《2020年度中国医院综合排行榜》，中国医学科学院北京协和医院位列榜首。